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講演要旨
近年、マルチオミクス研究に基づくがん治療薬・診断薬の開発が急速に進展し、臨床応用が進んでいる。本講演では、我々が確立したプロテオゲノミクス解析を基盤とする新規がん診断技術について紹介する。従来のcfDNAを用いた変異DNA診断に対し、血中・尿中の細胞外小胞（EV）に内包される体細胞変異タンパク質を直接検出するリキッドバイオプシーを開発した。膀胱癌42症例を対象に、腫瘍組織、培養上清由来EV、尿EVの包括的プロテオゲノミクス解析を行い、尿EV中から体細胞変異タンパク質を同定・定量した。これらは術後経過や膀胱鏡所見と良好に一致し、低侵襲な再発モニタリング・診断モダリティとしての有用性が示唆された。
講演要旨
空間トランスクリプトーム解析は、遺伝子発現情報と組織内位置情報を統合し、腫瘍微小環境や腫瘍細胞の特性を包括的に理解する革新的技術である。本演題では、病理形態学的視点を活かした解析の意義を概説する。病理知見を取り入れることで、解析結果は遺伝子マップの段階から組織学・臨床情報と統合されたトランスレーショナルデータに変換され、生物学的妥当性や臨床的解釈性をより高められると考えられる。本演題では、その解析手法と応用の可能性を紹介する。
講演要旨
がんの治療反応性や耐性、再発といった挙動は、ゲノムやトランスクリプトーム情報のみでは十分に説明できず、機能主体である蛋白質・代謝物の構造機能に加え、合成・分解や基質利用の動態を含めて理解することが重要である。そこで我々は、正常組織とは異なる分子・機能の実体を捉えることを目的に、プロテオゲノミクスおよびノンターゲットメタボロミクスによる疾患特異的分子群の解析に取り組んでいる。さらに、安定同位体トレーサーを用いた代謝Flux解析および蛋白質ターンオーバー解析により、代謝選択や生合成・分解速度を定量化し、静的量では捉えられない機能状態の可視化を推進している。本講演では、これら統合的機能オミクスの解析事例とその応用可能性について紹介したい。
小伊藤拓海氏
サーモフィッシャーサイエンティフィック
ライフテクノロジーズジャパン株式会社
バイオサイエンス事業部 テクニカルセールススペシャリスト
本セミナーでは、空間生物学・空間プロテオミクス研究における蛍光イメージングの最新手法として、EVOS S1000を中心に紹介します。従来の顕微鏡では制限されていた多重免疫染色に対し、スペクトルアンミキシング技術により最大9色の同時撮影を実現し、迅速かつサンプルダメージを抑えたデータ取得が可能です。あわせて、ダイレクトコンジュゲート抗体やTSAベースのAluora増幅試薬を用いた実践的ワークフローを解説し、空間情報を活かした高再現性の解析手法を提案します。
建田潮氏
株式会社 エービー・サイエックス
アプリケーションサポート部
がん研究においても、1細胞解析、マイクロダイセクション、イムノペプチドミクスなど、感度を必要とする分析のニーズは増えており、感度の重要性は増している。低濃度のタンパク質の解析においては、単純なイオン量だけではなく、MS/MSスペクトル取得感度やc’やz’系列のフラグメントを含めたスペクトルの正確性が高いことが、ペプチドの同定や比較定量において重要である。また、電子励起解離（EAD）フラグメント法においては、これまで感度がボトルネックとなって実際の分析に応用されない場合があった。本講演では、最新の質量分析計における感度の向上について、種々のサンプルに対するプロテオーム解析の実例を交えて報告する。
鶴巻宣秀氏
ライカ マイクロシステムズ株式会社
アプリケーション部 シニアリサーチャー
本講演では、病理画像とAI解析で細胞・微小領域を同定し、レーザーマイクロダイセクションで回収した試料を高感度質量分析につなぐDeep Visual Proteomics（DVP）/単一細胞DVP（scDVP）の考え方を、がん組織での実装例に沿って解説します。 DVPは腫瘍内不均一性や腫瘍免疫微小環境の“機能状態”を空間情報とともにタンパク質レベルで読み解くことが示されており、mipDVPなど多重イメージング統合も進展しています。 FFPEを含む臨床検体での応用を見据え、Leica LMD7を用いたサンプルの回収方法についてご紹介いたします。
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